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Geneformics發布基因組測序數據壓縮方案

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Geneformics D大幅提高基因組數據在云端上傳、下載、存儲及備份的效率(最高可達本來的10倍)

美國加州森尼韋爾市——Geneformics數據系統有限公司(以下簡稱“Geneformics”)是基因組IT架構領導者之一,專注于提高第二代測序(NGS)數據的傳輸、存儲及備份的效率。Geneformics今日正式發布Geneformics D,一款專為基因組數據設計的分布式云端壓縮解決方案。Geneformics D將基因數據上傳,下載,存儲和備份的速度及效率提高近10倍,同時降低90%的成本。

與現有應用差別,Geneformics D被整合到云端架構中,從而提供無縫,可拓展辦事,而非生硬地作為一款應用添加于基因組工作流程中。

Geneformics D基于Geneformics與以色列魏茨曼研究所共同研發的無損壓縮技術,可為基因組云端程序提供企業級的基礎設施辦事(IaaS)。運用Geneformics D技術,從人群測序、基因庫、遺傳、罕見疾病、癌癥和基因組學藥物治療研究中提取的精準醫學數據可被自動壓縮,這一過程對用戶透明,從而高效地節省時間,帶寬及大量存儲空間。

Geneformics CEO Rafael Feitelber 體現:“精準醫學正在促使醫療及研究機構將基因組數據分析過程從當地向云端架構遷移, 因為云端架構的高可擴展性,共享性和易用性更具有吸引力。現在,通過Geneformics D技術,相關機構可以通過云端高可擴展的無縫基因組數據壓縮大大加快數據分析流程,減少儲存需求。

Geneformics公司的創始人兼CTO Arik Keshet體現:“單個人類全基因組測序的數據量大約為250-300GB,Geneformics目前致力解決海量數據給第二代測序從業人員所帶來的巨大挑戰。通過使用Geneformics D技術,經壓縮的全基因組數據大小僅有本來的十分之一。同時,由于Geneformics D技術與底層架構的無縫整合,,使得用戶不需要改變任何的數據格式和應用接口。

Geneformics D采用分布式的、云端壓縮文件系統,目前已整合至亞馬遜網絡辦事(AWS),Geneformics D未來版本將會陸續整合其他云辦事提供商。Geneformics D軟件安置在每個計算實例上,協同實現一個對象即文件(object-as-file),經過透明壓縮的Linux尺度文件系統。Geneformics D動態解壓縮技術讓采用原生FASTQ和BAM格式的數據分析應用不需修改即可使用,從而保證對生物信息流程的影響最小。

其他Geneformics D功能包孕:

在實例連接的磁盤上,智能緩存解壓文件段,并加速數據分析進程。

與計算基礎架構的無縫整合,具有幾乎無限的拓展能力。

自動化云端基因組數據存儲辦理(專利申請中),可將數據引導至最具成本效益的存儲層。通過細粒度的對象儲存分層,在空間壓縮的成本節省的基礎上還可以再節約高達50%的成本。

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Geneformics是基因組數據辦理和壓縮技術的全球領導者之一。Geneformics依托生物信息學家、計算機工程師及以色列魏茨曼研究所共同開發的專有技術,降低大數據的復雜性,使得可以輕松拜候海量基因組數據。公司的解決方案已被全球多家公司采用,以優化數據傳輸、存儲和備份,鞭策精準醫學發展。Geneformics在美國硅谷和以色列均設有服務處,由國際知名的風險投資基金提供資金保障。

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