一、當前用戶專有的啟動文件夾
這是許多應用軟件自動啟動的常用位置，Windows自動啟動放入該文件夾的所有快捷方式。用戶啟動文件夾一般在：＼Documents and Settings＼用戶名字>＼“開始”菜單＼程序＼啟動，其中“用戶名字>”是當前登錄的用戶帳戶名稱。
二、對所有用戶有效的啟動文件夾
這是尋找自動啟動程序的第二個重要位置，不管用戶用什么身份登錄系統，放入該文件夾的快捷方式總是自動啟動——這是它與用戶專有的啟動文件夾的區別所在。該文件夾一般在：＼Documents and Settings＼All Users＼“開始”菜單＼程序＼啟動。
三、Load注冊鍵
介紹該注冊鍵的資料不多，實際上它也能夠自動啟動程序。位置：HKEY_CURRENT_USER＼Software＼Microsoft＼WindowsNT＼CurrentVersion＼Windows＼load。
四、Userinit注冊表鍵
位置：HKEY_LOCAL_MACHINE＼SOFTWARE＼Microsoft＼WindowsNT＼CurrentVersion＼Winlogon＼Userinit。這里也能夠使系統啟動時自動初始化程序。通常該注冊鍵下面有一個userinit.exe，如圖一，但這個鍵允許指定用逗號分隔的多個程序，例如“userinit.exe,OSA.exe”(不含引號)。
五、Explorer＼Run注冊表鍵
和load、Userinit不同，Explorer＼Run鍵在HKEY_CURRENT_USER和HKEY_LOCAL_MACHINE下都有，具體位置是：HKEY_CURRENT_USER＼Software＼Microsoft＼Windows＼CurrentVersion＼Policies＼Explorer＼Run，和HKEY_LOCAL_MACHINE＼SOFTWARE＼Microsoft＼Windows＼CurrentVersion＼Policies＼Explorer＼Run。
六、RunServicesOnce注冊表鍵
RunServicesOnce注冊鍵用來啟動服務程序，啟動時間在用戶登錄之前，而且先于其他通過注冊鍵啟動的程序。RunServicesOnce注冊鍵的位置是：HKEY_CURRENT_USER＼Software＼Microsoft＼Windows＼CurrentVersion＼RunServicesOnce，和HKEY_LOCAL_MACHINE＼SOFTWARE＼Microsoft＼Windows＼CurrentVersion＼RunServicesOnce。
七、RunServices注冊表鍵
RunServices注冊鍵指定的程序緊接RunServicesOnce指定的程序之后運行，但兩者都在用戶登錄之前。RunServices的位置是：HKEY_CURRENT_USER＼Software＼Microsoft＼Windows＼CurrentVersion＼RunServices，和HKEY_LOCAL_MACHINE＼SOFTWARE＼Microsoft＼Windows＼CurrentVersion＼RunServices。
八、RunOnce＼Setup注冊表鍵
RunOnce＼Setup指定了用戶登錄之后運行的程序，它的位置是：HKEY_CURRENT_USER＼Software＼Microsoft＼Windows＼CurrentVersion＼RunOnce＼Setup，和HKEY_LOCAL_MACHINE＼SOFTWARE＼Microsoft＼Windows＼CurrentVersion＼RunOnce＼Setup。
九、RunOnce注冊表鍵
安裝程序通常用RunOnce鍵自動運行程序，它的位置在HKEY_LOCAL_MACHINE＼SOFTWARE＼Microsoft＼Windows＼CurrentVersion＼RunOnce和HKEY_CURRENT_USER＼Software＼Microsoft＼Windows＼CurrentVersion＼RunOnce。HKEY_LOCAL_MACHINE下面的RunOnce鍵會在用戶登錄之后立即運行程序，運行時機在其他Run鍵指定的程序之前。HKEY_CURRENT_USER下面的RunOnce鍵在操作系統處理其他Run鍵以及“啟動”文件夾的內容之后運行。如果是XP，你還需要檢查一下HKEY_LOCAL_MACHINE＼SOFTWARE＼Microsoft＼Windows＼CurrentVersion＼RunOnceEx。
十、Run注冊表鍵
Run是自動運行程序最常用的注冊鍵，位置在：HKEY_CURRENT_USER＼Software＼Microsoft＼Windows＼CurrentVersion＼Run，和HKEY_LOCAL_MACHINE＼SOFTWARE＼Microsoft＼Windows＼CurrentVersion＼Run。HKEY_CURRENT_USER下面的Run鍵緊接HKEY_LOCAL_MACHINE下面的Run鍵運行，但兩者都在處理“啟動”文件夾之前。
